Главный принцип в экспертизе — принцип специальных знаний. Различные типы знаний имеют разные возможности использования специальных знаний в данной области. Во многом это зависит от общенаучного уровня и от уровня конкретной методологии судебно-медицинской экспертизы, от объекта исследования и характера поставленных задач. Есть также некоторые особенности, касающиеся области знаний. В отличие от других следственных действий, использование экспертизы выходит далеко за рамки уголовного и гражданского судопроизводства.

Назначение экспертизы в уголовном и гражданском судопроизводстве обусловлено абсолютной необходимостью для выяснения некоторых обстоятельств дела, требующего применения специальных знаний. Общий принцип — это принцип оценки заключения эксперта как в уголовном, так и в гражданском судопроизводстве, поскольку суд оценивает заключение эксперта вместе с другими доказательствами по делу.

За пределами лаборатории находятся судебно-экономическая экспертиза, большая часть судебно-медицинской, инженерной, судебно-биологической (ботанической, зоологической, энтомологической и микробиологической), пожарно-технической и сельскохозяйственной экспертизы.

Практика показывает, что введение таких правил отвечает обоюдным интересам всех сторон, вовлеченных в процесс сбора и использования вещественных доказательств и средств доказательства. Они гарантируют подлинность, сохранность следов и вещественных доказательств в том виде и в том состоянии, в котором они были обнаружены и изъяты, до тех пор, пока они не будут предоставлены для лабораторных исследований.